Deux présentations ont illustré la diversité des recherches au sein de la communauté BIOTIC.
Matthieu Legendre (DR CNRS, IGS) a exploré les virus géants et leurs interactions complexes grâce à des approches multi-omiques, mettant en lumière leur diversité et leur rôle dans les réseaux cellulaires. (présentation PDF)
Capucine Lecam-Ligier (Doctorante, MIO) a étudié les bactéries bioluminescentes des poissons mésopélagiques, révélant leur rôle dans la pompe biologique à carbone à partir de données metabarcoding. Ces interventions ont suscité des discussions enrichissantes prolongées lors de la pause café. (présentation PDF)
Table ronde : Métabarcoding
La discussion a porté sur le développement d’une formation spécialisée en metabarcoding pour 2025, visant à décrypter la diversité microbienne à partir de marqueurs génétiques. La formation s’adressera principalement aux membres du réseau BIOTIC et couvrira des aspects comme le choix des marqueurs, les stratégies de séquençage (short/long reads) et les analyses de diversité. Des outils tels que R, RStudio, et des machines virtuelles seront utilisés, avec des contenus adaptés à différents niveaux de compétence.
Table ronde : Transcriptomique spatiale
Cette session a exploré les technologies et les défis bioinformatiques liés à la transcriptomique spatiale, comme la résolution des données, le stockage, et l’analyse 3D. La réflexion a mis en avant l’importance des bioinformaticiens dans le design expérimental et la standardisation des données. BIOTIC pourrait proposer des formations et promouvoir des initiatives de FAIRisation pour structurer ce domaine en pleine expansion.
Ces échanges reflètent l’engagement de BIOTIC à développer des formations adaptées et à fédérer la communauté scientifique autour de nouvelles technologies.
Compte rendu complet :